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概率主成分分析联合支持向量机的前列腺SELDI-TOF质谱数据分析方法研究  期刊论文  

  • 编号:
    6d7f3648-3d5f-45b3-a2d2-0998a50c8d61
  • 作者:
    李肃义;嵇梦颖;徐壮;王跃洋;申博文;熊文激;
  • 地址:
    吉林大学仪器科学与电气工程学院;吉林大学化学学院;吉林大学第一医院;
  • 语种:
    中文
  • 期刊:
    分析测试学报 ISSN:1004-4957 2016 年 35 卷 1 期 (91 - 95) ; 2016/1/25 0:00:00
  • 收录:
  • 关键词:
  • 摘要:

    基于前列腺癌检测中获取的表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)数据,提出一种概率主成分分析(PPCA)联合支持向量机(SVM)的分类方法。对临床322例血清样本的质谱数据进行特征提取,以随机选取训练样本集(225例)构造SVM判别模型,对剩余样本集(97例)进行测试。采用均方根误差、识别率与预测率指标,将所构造的PPCA-SVM模型分别与偏最小二乘(Partial least squares,PLS)和PCA-SVM模型进行比较,发现PLS模型的识别率和预测率分别为90.92%和76.38%,PCA-SVM模型分别为99.23%和84.63%,而PPCA-SVM模型分别为99.01%和90.41%。因此SELDI-TOF-MS技术结合PPCA-SVM在样品分类中具有准确、重复性好等优点,为前列腺癌早期诊断提供了一种新方法。

  • 推荐引用方式
    GB/T 7714:
    李肃义,嵇梦颖,徐壮, 等. 概率主成分分析联合支持向量机的前列腺SELDI-TOF质谱数据分析方法研究 [J].分析测试学报,2016,35(1):91-95.
  • APA:
    李肃义,嵇梦颖,徐壮,王跃洋,&熊文激.(2016).概率主成分分析联合支持向量机的前列腺SELDI-TOF质谱数据分析方法研究 .分析测试学报,35(1):91-95.
  • MLA:
    李肃义, et al. "概率主成分分析联合支持向量机的前列腺SELDI-TOF质谱数据分析方法研究" .分析测试学报 35,1(2016):91-95.
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